北京時間2022年2月16日，國際頂級學術(shù)刊物Cell在線發(fā)表了南京農(nóng)業(yè)大學動物醫(yī)學院/前沿交叉研究院聯(lián)合中山大學醫(yī)學院以及軍事獸醫(yī)研究所等國內(nèi)外單位完成的研究論文：“Virome characterization of game animals in China reveals a spectrum of emerging pathogens”。論文共同通訊作者為我校粟碩教授（Lead contact）、中山大學施莽教授、悉尼大學愛德華·霍爾姆斯教授。我校博士研究生何婉婷、中山大學博士研究生侯新、我校碩士研究生趙晉為論文共同第一作者。這是南京農(nóng)業(yè)大學首次以第一通訊作者單位在CELL發(fā)表研究成果，也是我國動物傳染病防控領(lǐng)域的突破性研究進展。
據(jù)統(tǒng)計，70%以上的人類傳染病病原來自動物。因此，研究與人類或者家畜可能密切接觸的野生動物病毒攜帶情況與多樣性，對人類和家畜新發(fā)傳染病的防控至關(guān)重要。該論文對來自中國20個省份18個物種共1941只哺乳動物的樣本展開了系統(tǒng)的病毒轉(zhuǎn)錄組研究，發(fā)現(xiàn)13個病毒科中的102種病毒可以感染哺乳動物（圖1），其中65種病毒為首次發(fā)現(xiàn)存在于哺乳動物中，例如：海貍鼠輪狀病毒（Coypu rotavirus）、穿山甲瘟病毒（Pangolin pestivirus）、竹鼠札幌病毒（Bamboo rat sapovirus）等。該研究極大的拓展了對多種野生動物攜帶病毒多樣性的認識，為人類和家畜疫病預警和防控提供了重要科學依據(jù)。
圖1：野生動物中攜帶的與脊椎動物相關(guān)的病毒
在本研究中報道了豪豬丁型冠狀病毒（Deltacoronavirus HKU17），牛副流感病毒3型（Bovine parainfluenza virus 3）、哺乳動物正腮腺炎病毒5型（Mammalian orthorubulavirus 5）、H9N2亞型流感病毒(Influenza A virus H9N2)等21種對人類和家畜具有潛在高傳播風險的病毒。發(fā)現(xiàn)貉、果子貍、竹鼠、豪豬、刺猬等多種野生動物可攜帶冠狀病毒，其中腹瀉的貉樣本中攜帶的四株新型犬冠狀病毒（Canine coronavirus，CCoV）與最新報道的可導致人類疾病的重組CCoV毒株CCoV-HuPn-2018的基因同源性達93.65%-94.27%；基于病毒刺突蛋白（Spike protein, S）中的非重組區(qū)域分析發(fā)現(xiàn)四株新的貉CCoV形成了一個單獨的譜系（圖2）。因此，這種冠狀病毒的跨物種傳播風險值得關(guān)注。本研究還發(fā)現(xiàn)了多種高豐度的輪狀病毒(Rotavirus)，包括A、B、C、D和I群。兔、貉、豪豬和海貍鼠等動物均攜帶輪狀病毒A群。同時高豐度的輪狀A群、C群和I群的共感染在腹瀉的貉中發(fā)現(xiàn)，提示輪狀病毒存在跨物種傳播和公共衛(wèi)生風險。
圖2：貉CCoV的基因組重組與進化分析
盡管這些野生動物不一定是這些高風險病毒的存儲宿主（圖3），但可能會作為中間宿主通過跨物種傳播，把病原體傳播給人類和家畜。該研究結(jié)果還表明，一些看似健康的動物身上也可以攜帶和人類致病密切相關(guān)的病毒，并且在不同物種之間持續(xù)傳播。這再次凸顯了交易、食用以及密切接觸野味動物的風險，揭示野生動物作為疾病出現(xiàn)的潛在驅(qū)動因素的重要性。同時，研究結(jié)果可為新發(fā)傳染病防控關(guān)口前移等重大疫病防控政策制定提供新的思路。
圖3：野生動物攜帶潛在人畜共患病病毒與宿主之間的關(guān)聯(lián)分析
本研究受到國家自然科學基金優(yōu)青基金（31922081）等項目支持資助，同時貉冠狀病毒流行病學研究得到了國家重點研發(fā)計劃項目課題“畜禽冠狀病毒的流行傳播特征與遺傳演化規(guī)律（2021YFD1801101）”支持資助。
論文鏈接：https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867422001945
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