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科普:新型冠狀病毒源于自然 而非實(shí)驗(yàn)室

時(shí)間:2020-02-14來1源:科學(xué)網(wǎng) 作者:李海鵬 潘逸萱 趙方慶

冬春交接之際,新型冠狀病毒(2019-nCoV,或COVID-19)引起的肺炎正以迅雷不及掩耳之勢威脅著人民的生命健康,迫使14億人一夜間繃緊了神經(jīng),采取了一系列的防控措施,比如戴口罩,勤洗手,少外出。每個(gè)人都在屏息關(guān)注病毒傳播速度和其所致死亡率,也在關(guān)心著戰(zhàn)斗在疫情第一線的醫(yī)生和護(hù)士,關(guān)心著自己和親人的健康。在此新型冠狀病毒防控的緊要關(guān)頭,新型冠狀病毒系“實(shí)驗(yàn)室人造病毒”的言論充斥著網(wǎng)絡(luò),混肴視聽,讓人莫衷一是。然而,目前的研究發(fā)現(xiàn),導(dǎo)致這一疫情的原因很可能是由于新型冠狀病毒悄悄地從蝙蝠經(jīng)過中間宿主穿山甲傳播給人,進(jìn)而引發(fā)了這場災(zāi)難。

通過對(duì)2月4日前國內(nèi)外科學(xué)家發(fā)表的71篇新型冠狀病毒相關(guān)論文(中科院上海生命科學(xué)信息中心搜集)進(jìn)行分析總結(jié),綜合考慮穿山甲攜帶冠狀病毒的科學(xué)研究論文(Liu et al., 2019, Viruses),以及2月7日華南農(nóng)業(yè)大學(xué)從穿山甲中分離出的和新型冠狀病毒相似度達(dá)99%的毒株的報(bào)道,總結(jié)出了新型冠狀病毒來自于自然界的這一科學(xué)結(jié)論。其中圖1清晰地說明了此次的新型冠狀病毒、SARS病毒、中東呼吸綜合征冠狀病毒(MERS病毒),與蝙蝠和中間宿主之間的關(guān)系。

圖1、新型冠狀病毒,SARS病毒,中東呼吸綜合征冠狀病毒,蝙蝠和中間宿主的關(guān)系。結(jié)論來自于71篇最新的新型冠狀病毒相關(guān)的科學(xué)研究論文,穿山甲攜帶冠狀病毒的科學(xué)研究論文(Liu et al., 2019,Viruses),以及2月7日華南農(nóng)業(yè)大學(xué)從穿山甲中分離出的、和新型冠狀病毒相似度達(dá)99%的毒株的報(bào)道(科學(xué)研究論文和數(shù)據(jù)待發(fā)表,所以標(biāo)示為待檢驗(yàn))。修改自自然-微生物學(xué)評(píng)論(Cui et al., 2019, Nature Review Microbiology),供圖:施懌、林欣。

新型冠狀病毒和SARS病毒以及其它的冠狀病毒比較起來,究竟有什么差別呢?其實(shí),它們的基因結(jié)構(gòu)幾乎一模一樣(圖2);這些病毒極簡潔又高效,幾乎沒有多余的序列,整個(gè)基因組均被編碼蛋白質(zhì)的基因占據(jù)了。另外科學(xué)家們還發(fā)現(xiàn),新型冠狀病毒和穿山甲攜帶的冠狀病毒(數(shù)據(jù)和文章待發(fā)表,仍需進(jìn)一步檢驗(yàn))很可能進(jìn)化關(guān)系最近,序列的差異僅為1%;其次為蝙蝠攜帶的冠狀病毒,序列的差異僅約為4~11%;與SARS病毒的序列差異約為30%。另外特別重要的是,我們比較了新型冠狀病毒和蝙蝠攜帶的冠狀病毒的基因組序列,發(fā)現(xiàn)這些序列差異散布在整個(gè)冠狀病毒的基因組中,并非聚集于某一區(qū)域(圖3)。這些均是新型冠狀病毒源于自然界的重要證據(jù)。

圖2、新型冠狀病毒、蝙蝠攜帶的一種冠狀病毒、SARS病毒結(jié)構(gòu)的比較,每個(gè)彩色方塊代表了一個(gè)編碼蛋白質(zhì)的基因。修改自Wu et al., 2020, Nature。

圖3、新型冠狀病毒與2013年發(fā)現(xiàn)的中菊頭蝠(Rhinolophusaffinis)中的冠狀病毒(RaTG13)序列相似性高達(dá)96%,豎直紅線代表兩者基因組中有差異的位點(diǎn)。序列比對(duì)采用NCBI BLAST程序。供圖:李軒、郝沛。

另外在復(fù)旦大學(xué)的研究(Xiong et al., 2020, bioRxiv)中,科學(xué)家們比較了不同的新型冠狀病毒菌株,發(fā)現(xiàn)很可能從中間宿主傳染人的時(shí)間點(diǎn)發(fā)生在疾病大流行的前3~7個(gè)月。并且在多個(gè)獨(dú)立的研究中,多個(gè)研究組針對(duì)冠狀病毒不同基因片段進(jìn)行的進(jìn)化分析和序列比較分析,均檢測不到新型冠狀病毒基因組中人為遺傳操作的痕跡。因此上述所有的分析,都說明新型冠狀病毒是自然進(jìn)化與突變而來,可以完全否定“實(shí)驗(yàn)室人造”新型冠狀病毒的論斷。

那突如其來的“實(shí)驗(yàn)室人造病毒”論源于何處呢?2月2日有九位印度學(xué)者在未經(jīng)同行評(píng)議的預(yù)印本bioRxiv網(wǎng)站上公布了他們的論文,宣稱新型冠狀病毒的序列中存在艾滋病病毒的序列。許多人誤以為這就是“實(shí)驗(yàn)室人造病毒”的證據(jù),并在自媒體上傳播消息。而事實(shí)上,這九位印度學(xué)者的分析存在很大的漏洞,他們忽略了來自其余病毒,尤其是冠狀病毒的同源序列,因此得出了錯(cuò)誤的結(jié)論。在科學(xué)界的一片批評(píng)聲中,日前這九位印度作者已主動(dòng)撤稿。

網(wǎng)上傳言列舉的“實(shí)驗(yàn)室人造病毒”的另一根據(jù)是,在新型冠狀病毒中,負(fù)責(zé)與人呼吸道上皮細(xì)胞受體ACE2結(jié)合的S-蛋白,有4個(gè)氨基酸被人為改造。這一說法,其實(shí)歪曲了相關(guān)文章的科學(xué)結(jié)論。原文中的結(jié)果,是發(fā)現(xiàn)這4個(gè)位置的氨基酸,跟非典SARS冠狀病毒不一樣,而這其實(shí)正是病毒在自然界中進(jìn)化的證據(jù)(Xu et al., 2020, SCIENCE CHINA Life Sciences)。國外同行們(Benvenuto et al.,2020,J Med Virol)也分析了在不同的地點(diǎn)(武漢,浙江,廣東等)取樣獲得的新型冠狀病毒的序列,發(fā)現(xiàn)序列也有不同。因此,這種新型冠狀病毒在不同毒株之間的序列差異,以及新型冠狀病毒與其余冠狀病毒之間的序列差異,其實(shí)就是病毒進(jìn)化過程的具體表現(xiàn),并非“人造病毒”。通過SARS病毒的故事我們早已知道,病毒的變異和進(jìn)化,突破種屬屏障是病毒賴以生存和傳播的重要手段。

另外需要說明的是,正是通過對(duì)自然界蝙蝠,果子貍和穿山甲身上的寄生病毒的多年考察研究,科學(xué)家們進(jìn)一步認(rèn)識(shí)到了大自然中的很多生物,攜帶了對(duì)人類危害極大的病原體,比如SARS病毒。也正因?yàn)檫@些多年的基礎(chǔ)研究的積累,此次才能夠使科學(xué)家們快速地確定神秘肺炎的“元兇”--新型冠狀病毒,從而極大地幫助了臨床治療和防疫防控。

國難當(dāng)前,眾志成城,我們呼吁國民首要關(guān)注如何避免人傳人的病毒傳播,減少發(fā)病率和死亡率。同時(shí)希望科學(xué)界的有識(shí)之士多寫一些科普文章,給大家普及科學(xué)知識(shí),提高全民的科學(xué)素養(yǎng)!

本文作者:

李海鵬研究員,中科院上海營養(yǎng)與健康研究所

潘逸萱副研究員,華東師范大學(xué)

趙方慶研究員,中科院北京生科院

蘇梟研究員,中科院上海巴斯德研究所

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