“頭腦一熱,我就答應(yīng)了。”
這就是邱收與他人生中第一篇學(xué)術(shù)代表作結(jié)緣的時刻。
2019年底,中國科學(xué)院腦科學(xué)與智能技術(shù)卓越創(chuàng)新中心(以下簡稱腦智中心)徐春研究員正籌劃著“放大招”:為大腦中大名鼎鼎的海馬區(qū)繪制一幅三維立體的“交通線路圖”。
實現(xiàn)這項工作需要用到大量的計算機分析技術(shù),而徐春團隊主攻功能研究,要找出這么一個IT人才來,還真不容易。他找了一圈,多數(shù)人都不太想接這個“燙手山芋”,直到邱收走進他的辦公室。聽完導(dǎo)師徐春對項目的描述后,這個時年25歲、看起來清瘦文靜的博士生表示,他愿意試試。
因為邱收并沒有計算機基礎(chǔ),起初的計劃是他先做著,等后續(xù)有更合適的人選時可以退出。沒想到不久后的一場正式會議上,這項課題所屬的上海市級重大專項“小型模式動物全腦神經(jīng)聯(lián)接圖譜”負(fù)責(zé)人、腦智中心副主任孫衍剛研究員對他說:“這項工作就由你主導(dǎo)了。”
就這樣,邱收從一個入場較晚的小配角不知不覺間變成了“男一號”。當(dāng)初的頭腦一熱,讓他收獲了首篇以第一作者身份發(fā)表的Science論文:《海馬區(qū)單神經(jīng)元的全腦投射圖譜》。
發(fā)表論文截圖
師生合影 受訪者供圖(下同)
揭開大腦里的“清明上河圖”
海馬腦區(qū),可以說是最著名的大腦區(qū)域之一。徐春笑著把它比作“大腦中的朝陽區(qū)”。
科學(xué)家很早就發(fā)現(xiàn)海馬腦區(qū)與記憶功能緊密關(guān)聯(lián)。隨著近一個世紀(jì)不斷深入的研究,海馬腦區(qū)還被發(fā)現(xiàn)參與了多種不同大腦功能,如恐懼記憶、場景認(rèn)知、記憶泛化、情緒焦慮和社交記憶等。
海馬區(qū)中千絲萬縷、盤根錯節(jié)的神經(jīng)元,是如何完成這樣繁雜的任務(wù)的?這個問題仿佛藏在一座巨大的迷宮中,讓人很難窺得全貌。
徐春團隊要做的,就是為海馬區(qū)建立一個三維立體的“交通線路圖”,讓以后的科研工作者都能拿著這份“地圖”,知全局、有方向地開展研究工作。
神經(jīng)元(即神經(jīng)元細(xì)胞)是形態(tài)最特殊的細(xì)胞之一,乍看像一棵樹,細(xì)長彎曲如主干的一端叫軸突,分叉細(xì)密如樹冠的一端叫樹突。神經(jīng)元最大的特點是有方向性:神經(jīng)信號總是由樹突接收后,再從軸突輸出。所謂神經(jīng)元的“投射”,就是描述軸突把信號輸送到哪些地方。
“細(xì)長蜿蜒的軸突伸展出去,甚至能覆蓋一座大樓這么廣泛的位置。”徐春向《中國科學(xué)報》記者展示他們制作的可視化投射圖譜,“你看從這里到這里,只有一條單獨的軸突,但從這個點開始,分散到了許多軸突上。就像一群旅客乘坐飛機,一起到達(dá)機場后,很快分散,各奔東西——這就是對‘投射’最直觀的展現(xiàn)。你還會發(fā)現(xiàn),有些投射沒有走直線,而是繞了遠(yuǎn)路,這可能意味著要完成某個生理功能,需要連接這么多腦區(qū)。就像我們現(xiàn)實生活中,完成一件事情需要溝通許多職能部門。”
小鼠海馬單細(xì)胞全腦投射譜
這幅“交通線路圖”不僅是立體的,而且是動態(tài)的,就像是揭開藏在腦海中的“清明上河圖”,各種神經(jīng)細(xì)胞的神經(jīng)活動展示出了不為人知的一面。
“我們發(fā)現(xiàn)有些齒狀回細(xì)胞跳過了經(jīng)典的三突觸環(huán)路,可以直接投射到海馬區(qū)外的一些區(qū)域。這些現(xiàn)象超越了學(xué)術(shù)界以往的認(rèn)知,非常令人振奮。”徐春說。
為研究自學(xué)編程,“永遠(yuǎn)不要限制自己”
毫無疑問,這項工作涉及大量的計算、分析、編程等工作。而主要完成人邱收此前完全沒有相關(guān)經(jīng)驗。
為了自學(xué)編程,邱收主動從原有的實驗室搬出去,搬到腦智中心建設(shè)的一個公共研究平臺——全腦介觀神經(jīng)聯(lián)接圖譜研究平臺(小鼠)。這里匯聚了一批擅長數(shù)據(jù)管理分析的專業(yè)人士。
小半年時間里,邱收就和這些算法工程師們在一個辦公室里,“同吃同勞動”,學(xué)到了很多寶貴的專業(yè)技能。
邱收在實踐中發(fā)現(xiàn),這項研究很可能需要用到完全不同于以往的數(shù)據(jù)分析方法。在這樣一個重點項目中,要說服大家采用聞所未聞的新方法,需要他自己先把各種備選方法都測試一遍,用實際結(jié)果說話——這可是巨大的工作量。
就在研究如火如荼推進的時候,邱收生了一場重病。在病愈后的一段時間里,為了兼顧身體休養(yǎng)和研究進度,導(dǎo)師徐春支持他居家遠(yuǎn)程辦公。
幸運總會眷顧時刻努力的人,這些平日里搭建的遠(yuǎn)程辦公平臺,陰差陽錯地讓邱收后來在上海疫情最嚴(yán)重的時候,順利地完成遠(yuǎn)程分析工作,并最終取得了重要突破。
談起當(dāng)初為何愿意接下這樣一個特殊的工作,邱收坦言,他很清楚這是一個需要承擔(dān)風(fēng)險的項目,但在這個過程中,他會接觸到大量可遇不可求的寶貴數(shù)據(jù),也有機會做出一些非常重要的成果。
“神經(jīng)科學(xué)涉及的研究方法非常廣泛,你需要學(xué)習(xí)做手術(shù)、連電路、寫代碼……直到變成一個多面手。”如今的邱收,儼然是個點滿技能樹的“斜杠青年”。“這樣的經(jīng)歷也提示我,永遠(yuǎn)不要限制自己。你感興趣的事情,放手去做就好,遇到什么問題就去解決什么問題。”
邱收
目前,邱收已經(jīng)博士畢業(yè),在腦智中心作為特別研究助理繼續(xù)開展工作。他最感興趣的研究方向是神經(jīng)元編碼外界信息的機制解析。他希望找到一個可以開展相關(guān)工作的實驗室做博士后研究,也希望未來能繼續(xù)和導(dǎo)師徐春合作。
自豪!我為領(lǐng)域搞“基建”
投稿過程中,不止一位審稿人曾建議他們,可以把這篇論文中全海馬區(qū)的數(shù)據(jù)拆成數(shù)個亞區(qū)的部分,分別投稿。
如果這樣操作,作者或許會擁有更多頂刊論文,但他們還是決定,發(fā)表一篇最完整、最全面、最能幫助全世界同行的文章。
在這篇論文中,有一個特殊的網(wǎng)址:https://mouse.digital-brain.cn/hipp。
這是他們利用研究成果搭建起來的小鼠海馬區(qū)單神經(jīng)元的全腦介觀投射圖譜數(shù)據(jù)庫。不需要注冊賬號,打開網(wǎng)頁就可以直觀地看到凝結(jié)了科研人員心血的“交通線路圖”,還可以自由下載所需要的數(shù)據(jù)。
論文發(fā)表后,邱收的郵箱里常常會冒出世界各地同行的來信,咨詢他如何更好地使用這個網(wǎng)站,以幫助自己開展科研工作。
一位審稿人這樣評價:“這個數(shù)據(jù)集的產(chǎn)生對海馬領(lǐng)域非常重要!……我們已經(jīng)從這篇文章看到了很多新發(fā)現(xiàn)的聯(lián)接規(guī)律。”
另一位審稿人則連續(xù)使用了這樣的詞匯:讓人驚嘆的文章(amazing paper),真正的杰作(a real tour-de-force)、非凡的工具(a remarkable tool)。
如果把發(fā)表論文當(dāng)作最重要的產(chǎn)出,這個課題“性價比”不算高,似乎是“為他人作嫁衣裳”。
但徐春說:“我們不介意下笨功夫、苦功夫、慢功夫。相反,這是我迄今為止最自豪的工作。”
徐春
在科研界,要評估一項研究工作的影響力,可以假設(shè)這項科研工作沒有人做,再過20年,是否會影響到其他科研工作的進展,有些科學(xué)發(fā)現(xiàn)會不會因此推遲,甚至做不出來。
從這個意義上,徐春相信,他們是在為整個海馬區(qū)研究領(lǐng)域搞“基建”,把地基打好,把橋架好,把指示牌貼好,以后不論誰想在這個領(lǐng)域做出一點新東西,都能從中獲得便利,得到助力。
“成為科研人員以來,我時常想,自己正在研究的問題有意義嗎?至少對于這項工作,我相信它有著長遠(yuǎn)的意義。”邱收說。
論文DOI:
10.1126/science.adj919
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